Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG5

Arel1, Apoptosis-resistant E3 ubiquitin protein ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arel1Q8CHG5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Arel1Q8CHG5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arel1Q8CHG5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arel1Q8CHG5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arel1Q8CHG5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Arel1Q8CHG5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arel1Q8CHG5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arel1Q8CHG5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arel1Q8CHG5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arel1Q8CHG5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arel1Q8CHG5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms