Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CherpQ8CGZ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CherpQ8CGZ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CherpQ8CGZ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CherpQ8CGZ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CherpQ8CGZ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CherpQ8CGZ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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