Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifnl3Q8CGK6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnl3Q8CGK6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnl3Q8CGK6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnl3Q8CGK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnl3Q8CGK6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnl3Q8CGK6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnl3Q8CGK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnl3Q8CGK6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnl3Q8CGK6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnl3Q8CGK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnl3Q8CGK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms