Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Wdr47Q8CGF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr47Q8CGF6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Wdr47Q8CGF6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdr47Q8CGF6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr47Q8CGF6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms