Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap29Q8CGF1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap29Q8CGF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Arhgap29Q8CGF1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap29Q8CGF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms