Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx8Q8CFD4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx8Q8CFD4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx8Q8CFD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx8Q8CFD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx8Q8CFD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx8Q8CFD4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms