Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp27Q8CEG8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp27Q8CEG8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp27Q8CEG8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp27Q8CEG8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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