Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB76

Zfp449, Zinc finger protein 449, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp449Q8CB76 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp449Q8CB76 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp449Q8CB76 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp449Q8CB76 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp449Q8CB76 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp449Q8CB76 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp449Q8CB76 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp449Q8CB76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp449Q8CB76 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp449Q8CB76 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp449Q8CB76 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp449Q8CB76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp449Q8CB76 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp449Q8CB76 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms