Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol9bQ8C7I4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol9bQ8C7I4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol9bQ8C7I4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol9bQ8C7I4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol9bQ8C7I4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apol9bQ8C7I4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol9bQ8C7I4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol9bQ8C7I4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol9bQ8C7I4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms