Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E0

Cfap36, Cilia- and flagella-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap36Q8C6E0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfap36Q8C6E0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap36Q8C6E0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfap36Q8C6E0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfap36Q8C6E0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfap36Q8C6E0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfap36Q8C6E0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfap36Q8C6E0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap36Q8C6E0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cfap36Q8C6E0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap36Q8C6E0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap36Q8C6E0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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