Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp37Q8C0R0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp37Q8C0R0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp37Q8C0R0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp37Q8C0R0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp37Q8C0R0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp37Q8C0R0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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