Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef5Q8C0Q9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgef5Q8C0Q9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef5Q8C0Q9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef5Q8C0Q9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rapgef5Q8C0Q9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef5Q8C0Q9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef5Q8C0Q9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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