Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L0

Tmx4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx4Q8C0L0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmx4Q8C0L0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmx4Q8C0L0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmx4Q8C0L0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmx4Q8C0L0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmx4Q8C0L0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmx4Q8C0L0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx4Q8C0L0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmx4Q8C0L0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmx4Q8C0L0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms