Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim35Q8C006 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim35Q8C006 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim35Q8C006 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim35Q8C006 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim35Q8C006 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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