Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh12Q8BYK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rdh12Q8BYK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdh12Q8BYK4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh12Q8BYK4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdh12Q8BYK4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh12Q8BYK4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh12Q8BYK4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh12Q8BYK4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh12Q8BYK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh12Q8BYK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh12Q8BYK4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms