Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eda2rQ8BX35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eda2rQ8BX35 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eda2rQ8BX35 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eda2rQ8BX35 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eda2rQ8BX35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms