Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops7bQ8BV13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cops7bQ8BV13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops7bQ8BV13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops7bQ8BV13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms