Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ8

Kcns3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns3Q8BQZ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcns3Q8BQZ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcns3Q8BQZ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcns3Q8BQZ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcns3Q8BQZ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcns3Q8BQZ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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