Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DseQ8BLI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DseQ8BLI4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DseQ8BLI4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DseQ8BLI4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DseQ8BLI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.3 ms