Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ankrd55Q8BLD6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ankrd55Q8BLD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd55Q8BLD6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ankrd55Q8BLD6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ankrd55Q8BLD6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms