Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop53Q8BK35 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nop53Q8BK35 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop53Q8BK35 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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