Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn3bQ8BHK2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3bQ8BHK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3bQ8BHK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3bQ8BHK2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms