Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ9

Slu7, Pre-mRNA-splicing factor SLU7, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slu7Q8BHJ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slu7Q8BHJ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slu7Q8BHJ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slu7Q8BHJ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slu7Q8BHJ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slu7Q8BHJ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slu7Q8BHJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms