Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp4f39Q8BGU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp4f39Q8BGU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp4f39Q8BGU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp4f39Q8BGU0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp4f39Q8BGU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.5 ms