Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhot1Q8BG51 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhot1Q8BG51 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhot1Q8BG51 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhot1Q8BG51 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhot1Q8BG51 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rhot1Q8BG51 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms