Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1cQ7TSF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1cQ7TSF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1cQ7TSF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1cQ7TSF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1cQ7TSF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1cQ7TSF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dsg1cQ7TSF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms