Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc93Q7TQK5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc93Q7TQK5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc93Q7TQK5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc93Q7TQK5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc93Q7TQK5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc93Q7TQK5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc93Q7TQK5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc93Q7TQK5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc93Q7TQK5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc93Q7TQK5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms