Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQC5

Aptx, Aprataxin, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AptxQ7TQC5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AptxQ7TQC5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AptxQ7TQC5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AptxQ7TQC5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms