Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rtl1Q7M732 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rtl1Q7M732 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Rtl1Q7M732 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Rtl1Q7M732 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC43.82■■■■■ 4.6
Rtl1Q7M732 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Rtl1Q7M732 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Rtl1Q7M732 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Rtl1Q7M732 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Rtl1Q7M732 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Rtl1Q7M732 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Rtl1Q7M732 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
Rtl1Q7M732 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Rtl1Q7M732 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Rtl1Q7M732 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Rtl1Q7M732 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
Rtl1Q7M732 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rtl1Q7M732 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rtl1Q7M732 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rtl1Q7M732 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rtl1Q7M732 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Rtl1Q7M732 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Rtl1Q7M732 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
Rtl1Q7M732 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Rtl1Q7M732 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rtl1Q7M732 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rtl1Q7M732 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rtl1Q7M732 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Rtl1Q7M732 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Rtl1Q7M732 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Rtl1Q7M732 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Rtl1Q7M732 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Rtl1Q7M732 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Rtl1Q7M732 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rtl1Q7M732 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rtl1Q7M732 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Rtl1Q7M732 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Rtl1Q7M732 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Rtl1Q7M732 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Rtl1Q7M732 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Rtl1Q7M732 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Rtl1Q7M732 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Rtl1Q7M732 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rtl1Q7M732 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rtl1Q7M732 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms