Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sys1Q78S06 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sys1Q78S06 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sys1Q78S06 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sys1Q78S06 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms