Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mindy1Q76LS9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mindy1Q76LS9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mindy1Q76LS9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mindy1Q76LS9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mindy1Q76LS9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mindy1Q76LS9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms