Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd3eapQ76KJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd3eapQ76KJ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd3eapQ76KJ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd3eapQ76KJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd3eapQ76KJ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd3eapQ76KJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd3eapQ76KJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd3eapQ76KJ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd3eapQ76KJ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd3eapQ76KJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms