Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl35Q6ZWV7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rpl35Q6ZWV7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl35Q6ZWV7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl35Q6ZWV7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl35Q6ZWV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms