Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Igsf3Q6ZQA6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igsf3Q6ZQA6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Igsf3Q6ZQA6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igsf3Q6ZQA6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Igsf3Q6ZQA6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Igsf3Q6ZQA6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms