Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssx9Q6XAS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssx9Q6XAS3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssx9Q6XAS3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssx9Q6XAS3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssx9Q6XAS3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssx9Q6XAS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms