Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY52

Gm7247, Predicted gene 7247, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7247Q6UY52 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7247Q6UY52 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm7247Q6UY52 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm7247Q6UY52 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7247Q6UY52 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7247Q6UY52 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7247Q6UY52 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm7247Q6UY52 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms