Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ecm29Q6PDI5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ecm29Q6PDI5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ecm29Q6PDI5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm29Q6PDI5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ecm29Q6PDI5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ecm29Q6PDI5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms