Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc2Q6PDG5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarcc2Q6PDG5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarcc2Q6PDG5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarcc2Q6PDG5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Smarcc2Q6PDG5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarcc2Q6PDG5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarcc2Q6PDG5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms