Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Lce3fQ6PAI4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lce3fQ6PAI4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms