Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx6Q6P8X1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx6Q6P8X1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx6Q6P8X1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx6Q6P8X1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx6Q6P8X1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx6Q6P8X1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms