Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp2d40Q6P8N9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2d40Q6P8N9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2d40Q6P8N9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms