Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpa4Q6P8K8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpa4Q6P8K8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpa4Q6P8K8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpa4Q6P8K8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpa4Q6P8K8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms