Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm2bQ6P1G2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm2bQ6P1G2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm2bQ6P1G2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Kdm2bQ6P1G2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm2bQ6P1G2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdm2bQ6P1G2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Kdm2bQ6P1G2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kdm2bQ6P1G2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kdm2bQ6P1G2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Kdm2bQ6P1G2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kdm2bQ6P1G2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Kdm2bQ6P1G2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Kdm2bQ6P1G2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms