Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krba1Q6NXZ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krba1Q6NXZ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krba1Q6NXZ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krba1Q6NXZ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krba1Q6NXZ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krba1Q6NXZ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms