Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Asic1Q6NXK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Asic1Q6NXK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Asic1Q6NXK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Asic1Q6NXK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Asic1Q6NXK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Asic1Q6NXK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Asic1Q6NXK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Asic1Q6NXK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Asic1Q6NXK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Asic1Q6NXK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Asic1Q6NXK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms