Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Smarca2Q6DIC0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Smarca2Q6DIC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Smarca2Q6DIC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Smarca2Q6DIC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Smarca2Q6DIC0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Smarca2Q6DIC0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Smarca2Q6DIC0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
Smarca2Q6DIC0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Smarca2Q6DIC0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
Smarca2Q6DIC0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Smarca2Q6DIC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
Smarca2Q6DIC0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Smarca2Q6DIC0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Smarca2Q6DIC0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms