Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrcc1Q69ZB0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms