Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Knl1Q66JQ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Knl1Q66JQ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Knl1Q66JQ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Knl1Q66JQ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Knl1Q66JQ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Knl1Q66JQ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Knl1Q66JQ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Knl1Q66JQ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Knl1Q66JQ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Knl1Q66JQ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Knl1Q66JQ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Knl1Q66JQ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Knl1Q66JQ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms