Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2a3Q64518 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a3Q64518 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2a3Q64518 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp2a3Q64518 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2a3Q64518 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms