Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Top2bQ64511 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Top2bQ64511 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Top2bQ64511 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Top2bQ64511 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
Top2bQ64511 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Top2bQ64511 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Top2bQ64511 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Top2bQ64511 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Top2bQ64511 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Top2bQ64511 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Top2bQ64511 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Top2bQ64511 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Top2bQ64511 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Top2bQ64511 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Top2bQ64511 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Top2bQ64511 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Top2bQ64511 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Top2bQ64511 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Top2bQ64511 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Top2bQ64511 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Top2bQ64511 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Top2bQ64511 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Top2bQ64511 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Top2bQ64511 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Top2bQ64511 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Top2bQ64511 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Top2bQ64511 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Top2bQ64511 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Top2bQ64511 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2bQ64511 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms